医疗卫生事权主要由地方政府承担。中央政府主要负责宏观管理工作：一是负责对卫生行政进行全面的计划和指导，二是负责与医生、牙科医生、保健士、助产士、护士等有关的国家考试、执照发放，以及麻风病疗养所设置、医药品、兴奋剂、有毒物品、麻药生产等特殊事务的许可。

直接与国民生活相关的卫生行政、尤其是与公共卫生有关的事务则几乎全部由地方公共团体来负责。作为卫生行政的核心机关，在都道府县和政令指定的市，从事着内容极为广泛的公共卫生工作。此外，都道府县与市町村的卫生行政所负责的领域有着大致的分工，前者负责结核病预防、传染病预防等卫生防疫工作，后者则负责粪便处理、灰尘处理等环境卫生。从不同属性的医院数量上来看，地方政府的公立医院数量远远多于中央政府的国立医院。

国民健康保险和护理保险基本属于市町村政府事权，参保者由市町村政府提供保险服务，中央和都道府县政府均只对其运行进行指导；中央政府对医疗保险机构承担统筹规划和指导工作。都道府县政府主要负责对下级医疗保险机构的指导工作，同时负责国民健康保险审查委员会的设置。

国民健康保险机构的运行和管理主要落实到市町村政府。市町村设置国民健康保险运营协会，负责国民健康保险事业的运营，并承担健康保险事业管理职责。中央政府需要制定相关的政策方针，以确保护理保险顺畅运营。都道府县政府需对市町村护理保险事项进行支援并制定都道府县保险支援计划，包括相关财政性基金的设置，以及护理保险审查会的设置等，此外还需承担家庭护理机构的认定、审批、指导和监督等责任。市町村政府负责具体护理保险事项的实施和执行。

公共安全是政府为公民提供的重要公共服务之一，是政府职能范围内需履行的重要事权。在日本主要包括警察事务、消防事务和防灾事务三个方面。警察事权属于中央和都道府县政府共担事权，主要事务由都道府县政府承担。中央政府主要承担两项警察事务，分别为对都道府县的警察实行指挥监督，承担都道府县警察的定编职责。而都道府县设有道、府、县警察本部，负责辖区内的警务行政事务，对都道府县警察进行管理。都道府县政府承担承担警察学校的设置与管理职责。

消防及灾害救助事务的具体执行全由市町村政府负责。消防工作几乎全都成为市町村(东京则由东京都负责)政府的事务范围。中央政府主要承担消防相关政策的研究工作以及对市町村的消防进行劝告、指导、建议。目前在中央政府，作为自治省(现总务省)的外局(即直属总局)设置有消防厅，负责研究制定消防制度，研究消防职员及消防团员的培训标准，消防统计，与消防相关的试验研究，研究救生工作的标准；同时对市町村的消防进行劝告、指导、建议，但不从事实际的消防活动。

市町村负责消防的具体事务。市町村设置有消防本部、消防署和消防团，负责在火灾、风灾、水灾、地震等灾害中保护居民的生命、身体和财产安全。市町村的消防系统大致分为常设消防(即消防本署及消防署)和作为自卫消防的非常设性消防团。不过，近年来，非常设的消防团也已经基本上常备化了。市町村之间可以达成相互援助的有关协议，或者由数个市町村联合组成消防组织。在灾害频繁发生的日本，灾害对策也是地方公共团体的重要工作之一。防灾事务主要包括救灾工作和防灾工作两项内容，中央主要承担灾害救助工作，市町村主要负责防灾工作。