面对国内外的种种质疑，工程专家组的专家学者也有撰文回应。专家组成员、中科院陕西天文台研究员刘次沅就在《时间频率学报》（2002 , 25 (1) :70-73）上发表文章《天再旦日食的根据与计算——对Keenan质疑的注释》回应Douglas J. Keenan的质疑，中国社科院考古所副研究员徐良高也发表多篇文章与蒋祖棣进行讨论，专家组组长、中国社会科学院历史研究所所长李学勤也在接受采访表示，《简本》作为一个阶段性的学术成果，我们也没有想它就此成为定论，有争议很正常。

但总的来说，正如同夏商周断代工程对自身的定位：“现有材料下的最优解”。在目前的考古发现和技术条件下，给出了一个大致的年代框架，大量资金和技术的投入也对今后的考古学研究起到了推动作用。工程本身暴露出的问题（如绝对年代的把握困难很大）和取得的收获一直在给中国考古学输送营养。也许我们短时间内很难坐实夏朝作为一个文明的存在，中华文明也许只有3600多年，但这并不妨碍这片土地上的人们繁衍生息，欣欣向荣。中华民族曾经经历了太多的苦难，养成了坚忍不拔的性格。在未来，会以更加开放和自信的姿态，屹立于世界之林！

小记

其实说到文明断代，各古文明也并没有多少是“干净”的。记录古埃及王表的巴勒莫石碑、都灵王表、阿比多斯王表、卡纳克王表或残缺不全、或互相之间有出入；记录美索不达米亚的贝罗索斯王表亡佚，留存在他人著作中的部分则显示着作者惊人的想象力，统治者年龄动辄以万记；至于古希腊，靠着德国传奇考古学家海因里希·施里曼对普里阿姆宝藏和迈锡尼古墓葬的发现，才证实了颇具神话色彩的《荷马史诗》中特洛伊、迈锡尼的存在。

但遗憾的是，施里曼宣称在土耳其西萨里克山找到的特洛伊的遗址，实际上一共有9层不同年代的遗址，不论是哪一层都无法和特洛伊相吻合，其后继者亚瑟·伊文思在克里特岛对“米诺斯”文明的发掘也颇多疑点，其一些冲动、理想化的重建更是被后来的学者批评和否定，发现的线形文字A至今仍未破译。

出土的线形文字A

米诺斯三女神壁画

对比其他文明古国的断代历程，并不是要比烂，也不是要否定那些古文明的存在。只是想说史前考古和史前研究的局限性（考古本身就是一种巨大的破坏，如出土秦始皇陵兵马俑彩色的褪去，考古挖掘对地层的不可逆转毁坏等），受制于遗迹和文献的有限资源，史前研究很可能长期没有突破。

但这并不影响史前考古的继续发展，同样，夏商周断代工程有问题也不会影响中国上古考古的发展。虽然有些机构出于某些动机迫不及待要宣布一些重大的考古发现，显得太过着急，但时间会给出最终答案。

某地对二里头遗址的误导宣传

最后，以中国二里头考古队队长许宏的一段话来结尾：夏商周考古，从其定名看就具有浓厚的“中国特色”，注重“以复原王统历史为目的的研究”，或可说是“王统的考古学”。下一步，应超越传统的思维，以考古学为本位，构建可与全球文明史接轨的中国青铜时代研究话语体系，使研究视角与方法随着整个中国考古学的学科转型而得到提升。