台湾空难发生后第二天，复兴航空在上海再出故障！预定5日晚间10时15分要从大陆上海浦东机场飞往台湾的GE303航班，先是受机场管制延误，再因仪表版显示异常，又滑回检修；机上旅客透露，当时机长广播称发动机异常，吓得有72名旅客当场要求退票，最后飞机延误8小时，直到6日上午6时才起飞返台。观察者网此前报道，目前台湾飞机坠河事故原因聚焦在发动机上。

复航GE303班机，5日深夜11时15分要从上海浦东机场返回桃园机场，起飞前发现机件故障，复航表示并非发动机而是仪表板的电脑控制面板异常，但7日复航却派出工程人员，前往桃园机场外停机坪检修GE303班机的发动机。

复兴航空强调，GE303当天因为机场流量管制，耽误近2个小时，接获起飞许可后，飞机在滑行时，机上3组面板中的1组，突然出现讯号异常，基于安全考量，机组员决定返回检修，并非发动机出问题。

但机上旅客说，当时机长确实是广播“发动机有异常，要返回检修”，并抱怨，有5个多小时被留在飞机上，没空调只能干等，还有人大骂：“这种飞机谁还敢坐啊！”复航原本想安排旅客住宿，但后来又说飞机好了，只是仍有乘客心里觉得毛毛的，希望复兴另外派新的飞机来接，最后原本客满293人乘客中，有72人选择当场退票，复航也同意。

复航强调，影响旅客行程非常抱歉，并尊重旅客意愿协助退票，也非常感谢该班200多名旅客，仍愿意给复兴服务机会。