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我国首个国家基因库运营在即 将成全球最大生命信息平台
关键字: 首个国家基因库打造全球“朋友圈”
国家基因库将有序与国际上现有的三大基因库开展数据交换与共享,形成全球联盟体系,推动国家基因库向国际基因库转变,支撑引领生物大健康产业和生物经济快速发展。
在北冰洋上的挪威属地斯瓦尔巴特群岛(Svalbard),坐落着一个世界末日种子库(Svalbard Global Seed Vault),储存着来自世界各地数十万份植物种子的“备份”,因此被叫做“末日粮仓”“植物诺亚方舟”。
深圳国家基因库想象图
9月22日,国家基因库将宣布一项与挪威世界末日种子库的合作,双方将打造一个新的“入口”,让更多数据资源为全球所用。
开放合作,是国家基因库在组建和运营过程的主导观念之一。“国家基因库是一个开放平台,无论未来我们如何运营基因库,拥有的资源总是有限的,我们希望通过更好的机制,让大自然馈赠给人类的基因资源能被我们充分地认知和利用。”梅永红介绍,华大基因本身就是一个开放平台,与国内外机构有长期合作,国家基因库团队一直在与国内外机构联系和合作并取得不少进展,未来国家基因库一定会超越国界,成为全球范围内极具影响力、形成更多资源聚集的机构。
2014年8月,国家基因库主导的E-Biobank资源信息共享平台已经正式上线。它承担生物界“牵线人”的角色,为资源申请方(有资源需求的科研团队)和资源提供方(有样本资源的团队)提供了一个“相识”的平台。在这个网站的主页上显示着国家基因库的样本总量、样本库总量、疾病种类、物种数量等,研究人员可以检索、查询样本信息、申请使用,资源持有者也可以共享自己的样本信息,仿佛一个生物界的淘宝。
梅永红说,大资源、大平台、大合作意味着大数据的自然派生,多年来华大基因通过拥有大数据产生大科学,一年能“玩”出几十篇论文,华大基因的农业、医学服务也都是大科学衍生出来的。“掌握大数据,在形成对基因、遗传规律认知的基础上,对农业、健康领域的业务布局奠定了重要的科学基础。”
据介绍,国家基因库也将有序与国际上现有的三大基因库开展数据交换与共享,形成全球联盟体系,推动国家基因库向国际基因库转变,支撑引领生物大健康产业和生物经济快速发展。
目前,国家基因库已与国际生物和环境样本库协会(ISBER)、全球生物多样性联盟(GGBN)、挪威世界末日种子库、人类基因变异组计划(HVP)、中国科学院海洋研究所、中国科学院昆明动物研究所、北京重大疾病临床数据和样本资源库、国家超算深圳中心等100多家国内外科研机构、行业组织建立了战略合作关系,在人类健康、生物多样性、生物进化机制等方面开展了合作研究。
■焦点
国家基因库为何选址大鹏?
据国家基因库相关负责人介绍,基因库选址主要考虑三个因素。一是方便利用临近的LNG(液化天然气)码头气化过程中产生的大量冷能,用于冷却样品,节能环保;二是国家基因库的主体建筑是倚山体的自然坡度建设的,每一层都相当于是第一层,都有山体结构的支撑,稳固性非常好,可以摆放大型设备。三是深圳正在全力推进“东进战略”,将在深圳东部的大鹏半岛规划建设国际生物谷,并将其打造成为国际领先的生物科技创新中心,国家基因库是大鹏新区的重要产业基础设施,有助于生物产业提升创新能力。
国家基因库对产业有何影响?
“国家基因库不仅要形成数据,还要对数据进行分类、开发利用,会衍生出很多服务和机构,有很多机会。”梅永红告诉记者,国家基因库是一个公共服务平台,将提供多种公共产品和服务,需要与众多机构联合,与此同时,该平台也会按照市场机制衍生出一些产品和服务。
此外,国家基因库不仅是生物样本资源和生物信息数据的储存、利用平台,也将是一个科普平台。梅永红表示,希望未来能有更多的公众走进国家基因库,而且能与科学家进行更多的对话。社会公众将可以通过相应申请程序进入国家基因库参观。
深圳国家基因库主体工程已建成,投入使用在即。
■专访
专访国家基因库主任梅永红
基因库将是具有孵化功能的开放平台
南方日报:国家基因库为何会由华大基因组建和运营?
梅永红:我刚来华大的时候也曾经思考这个问题:为什么一个国家级平台要交给华大?第一,华大基因是全球最大的测序机构,建国家基因库并不仅仅是收集和保存基因资源,更要得到应用,需要有数字化的过程,这恰恰是华大基因的优势。第二,华大从1999年创立以来,拥有的基因数据是全球最大的,拥有的人类基因组数据一度占到全球的近50%,而且拥有超过70%的全球农业基因组数据。华大基因拥有的这些数据也是国家基因库特别是数据库中非常重要的资源。第三,华大基因作为一个民办官助的新型研究机构,在利用国内外资源方面比体制内的机构具有更好的条件,能让资源得到充分共享。
最初把这样一个平台交给华大组建和运营,是基于中国相关领域的发展态势以及过去科研平台存在的问题而形成的决策,我认为是非常开明、非常有远见的决策。
南方日报:据报道,国家基因库一期工程投资7.8亿元,资金来源是怎样的?
梅永红:其中国家和深圳市投入4个多亿,华大配套约3.6亿。为什么华大能投入这么多?华大和很多企业不一样,很多企业是先研发技术,然后把技术变成产品卖出去。但华大不是为赚钱而存在的,而是要在生命科学时代实现一个大目标,包括让每个人活得更健康,“消灭千种疾病、实现百岁健康”。
实现这个目标不能空谈,要有大资源、大平台,要把资源数据化,还要充分开展国际合作。华大自身现在已经按照这个路子走过来了,拥有大数据就能产生大科学,通过充分的国际合作、海量的数据能够衍生出大科学。华大的农业、医学服务都是大科学衍生出来的,通过掌握大数据形成对基因、遗传规律的认知,为农业、健康领域的业务布局奠定了重要的科学基础。
南方日报:国家基因库在整个产业链的作用是什么?华大基因的产业化收入能否支撑在科研上、国家基因库上的大手笔投入?
梅永红:国家基因库是一个公共平台,基因库进行资源的集聚和数据化一定需要技术和产业支撑。就数据库来说,不仅要形成数据,还要对数据进行分类、开发利用,衍生出商业领域的机构和服务,孵化出按照市场运作的产业体系,所以我确信基因库建成后在基因资源的存储、解读、开发和利用过程中能衍生出很多的产业方向。
另外,生命科学领域的科研和产业化工作是一个浩大的系统工程,不是华大一家机构能完成的,一定要众多机构联合。国家基因库的运营并不意味着华大基因把所有的任务都包了,比如种质资源,无论华大基因做多大的努力,也不可能把中国所有人、动物、植物、微生物资源都聚集在国家基因库,但它能为建立各类基因库提供标准,提供一种模式。我们也期待国家基因库成为一个类似孵化器的平台,让更多新模式走出来,利用这个平台提升中国在生物科技领域的能力。
人们评判一个机构应该看到它的成长性,超越传统以资产、当前盈利作为评判标准的思路。在研发投入上,上世纪90年代完成人类基因组草图需要多个国家科学团队10年的努力、30亿美元的投入,现在1周时间、1万美元就可以完成一个人的基因组框架图绘制,华大希望未来用1天时间、1000元人民币就完成这样的工作。(南方日报记者 马芳 陈熊海)
- 原标题:我国首个国家基因库即将正式运营
- 责任编辑:梁福龙
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